.. _PhysiCell_development_Cells:

Создание типа клеток
====================

.. role:: raw-html(raw)
   :format: html

.. |icon_cell_definition| image:: /images/icons/Physicell/cell_definition.png
.. |icon_remove_element| image:: /images/icons/remove_element.png


.. important::
   Клетки в модели - это не всегда биологические клетки, а просто действующие в среде агенты.

Чтобы добавить в модель тип клеток нужно на верхней панели нажать ЛКМ на |icon_cell_definition|, а затем нажать ЛКМ в любое место под панелью инструментов.

.. figure:: /images/Physicell/Physicell_model_development/Cell_creation.png
   :width: 100%
   :alt: Cell_creation
   :align: center

:raw-html:`<br>`
После этого в появившемся окне необходимо задать параметры создаваемого типа клеток:

.. figure:: /images/Physicell/Physicell_model_development/Cell_parameters.png
   :width: 60%
   :alt: Cell_parameters
   :align: center

:raw-html:`<br>`

- **Name**: название типа клеток.
- **Initial number**: исходное количество клеток данного типа.
- **Color**: цвет, с помощью которого клетки данного типа будут отображаться при симуляции модели.
- **Gradient**: отметьте ☑, если необходимо применить градиент к выбранному цвету.
- **Comment**: можете оставить любые комментарии для клеток данного типа.

.. note::
   При указании цвета в данном окне будет считаться, что все внутреннее содержимое клеток данного типа будет иметь выбранный цвет, контур клеток будет черным, а ядро отрисовываться не будет.

   Для более детальной настройки цвета следует воспользоваться вкладкой :ref:`Visualizer <PhysiCell_microenvironment_Visualizer>` или полем Custom Visualizer во вкладке :ref:`Model Report <Physicell_microenvironment_Model_Report>`.

После того, как заданы все параметры, нажмите **Ok**.

На экране у вас появится обозначение созданного вами типа клеток.

.. figure:: /images/Physicell/Physicell_model_development/Cells.png
   :width: 80%
   :alt: Cells
   :align: center

:raw-html:`<br>`
Таким образом можно создавать любое количество типов клеток в модели.

Чтобы переместить тип клеток на диаграмме, необходимо зажать его ЛКМ, переместить курсор на новое место и отпустить ЛКМ.

Чтобы удалить тип клеток из модели, необходимо нажать на него ЛКМ и нажать клавишу **Delete**.

Если вы работаете в веб-версии BioUML, то для удаления нужно:

1. Нажать на обозначение типа клеток ПКМ.
2. В раскрывающемся списке нажать ЛКМ на **Remove** |icon_remove_element|. 

Чтобы редактировать уже созданный тип клеток, нужно:

1. Нажать ПКМ на обозначение соответствующего типа клеток на диаграмме.
2. В раскрывающемся списке нажать ЛКМ на кнопку **Edit**.
3. Изменить нужные свойства.
4. Нажать **Ok**.