.. _PhysiCell_simulation:

Симуляция модели
================

.. role:: raw-html(raw)
   :format: html

.. |icon_generates_code_for_the_model_simulation_button| image:: /images/icons/Physicell/Generates_code_for_the_model_simulation_button.png
.. |icon_start_simulation_process| image:: /images/icons/Physicell/start_simulation_process.png
.. |icon_stop_simulation_process| image:: /images/icons/Physicell/stop_simulation_process.png
.. |icon_save_simulation_result| image:: /images/icons/Physicell/saves_simulation_result.png
.. |icon_open_plot_dialog| image:: /images/icons/Physicell/open_plot_dialog.png
.. |icon_clear_log| image:: /images/icons/Physicell/clear_log.png
.. |icon_option| image:: /images/icons/option.png
.. |icon_add_new| image:: /images/icons/Physicell/add_new.png
.. |icon_new_plot_document| image:: /images/icons/Physicell/new_plot_document.png
.. |icon_not_selected_point| image:: /images/icons/Physicell/not_selected_point.png
.. |icon_selected_point| image:: /images/icons/Physicell/selected_point.png
.. |icon_import| image:: /images/icons/Physicell/import.png
.. |icon_3_points_button| image:: /images/icons/Physicell/3_points_button.png
.. |icon_table| image:: /images/icons/Physicell/table.png
.. |icon_opened_folder| image:: /images/icons/Physicell/opened_folder.png
.. |icon_edit_specification_button| image:: /images/icons/Physicell/edit_specification_button.png
.. |icon_Java_code| image:: /images/icons/Physicell/Java_code.png

Чтобы настроить и запустить симуляцию модели нужно нажать ЛКМ на вкладку **Simulation**.

.. figure:: /images/Physicell/Physicell_simulation/Simulation_tab.png
   :width: 100%
   :alt: Simulation_tab
   :align: center

:raw-html:`<br>`
После этого в правом нижнем углу экрана у вас появится панель для настройки симуляции модели.

.. figure:: /images/Physicell/Physicell_simulation/Simulation_panel.png
   :width: 100%
   :alt: Simulation_panel
   :align: center

:raw-html:`<br>`
На этой вкладке можно выделить несколько областей:

.. figure:: /images/Physicell/Physicell_simulation/Simulation_panel_composition.png
   :width: 100%
   :alt: Simulation_panel_composition
   :align: center

:raw-html:`<br>`

- Кнопки для управления процессом симуляции (A).
- Вкладки для переключения между настройками параметров симуляции (Engine) и меню добавления переменных для вывода на график (Plots) (B).
- Область редактирования параметров симуляции (Engine) и меню добавления переменных для вывода на график (Plots) (C).
- Область вывода логов (D).

Далее мы подробно разберем каждую из этих областей.

.. toctree::
   :maxdepth: 2
   :hidden:
   
   PhysiCell_simulation_Buttons
   PhysiCell_simulation_Settings
   PhysiCell_simulation_Engine
   PhysiCell_simulation_Plots
   PhysiCell_simulation_General_files