Создание хемотаксиса

В результате хемотаксиса клетка движется по градиенту вещества к нему или от него.

Чтобы создать в модели хемотаксис, нужно:

  1. Нажать ЛКМ на значок icon_chemotaxis на панели инструментов.

  2. Нажать ЛКМ на тип клеток, который будет двигаться к/от определенного субстрата.

  3. Нажать ЛКМ на субстрат, к/от которого клетки выбранного типа будут двигаться.

Chemotaxis_creation


После этого на диаграмме появится стрелочка фиолетового цвета, направленная от субстрата к клетке.

Chemotaxis_reaction


Чтобы редактировать параметры созданного хемотаксиса, нужно нажать ПКМ на стрелку на диаграмме, обозначающую данный хемотаксис, и в раскрывающемся списке нажать ЛКМ на кнопку Edit.

Edit_chemotaxis


После этого в появившемся окне необходимо задать параметры изменяемого хемотаксиса:

Chemotaxis_parameters


  • Title: название хемотаксиса,

  • Comment: комментарий,

  • Substrate: название субстрата (не изменяется!),

  • Sensitivity: чувствительность к выбранному веществу.

Примечание

  • Положительные значения Sensitivity указывают на то, что клетка будет двигаться к субстрату, а отрицательные - от субстрата.

  • Абсолютное значение Sensitivity указывает на «силу» движения клетки к/от определенного субстрата.

После того как заданы все параметры, нажмите Ok.

Чтобы удалить хемотаксис из модели, необходимо нажать на него ЛКМ и нажать клавишу Delete.

Если вы работаете в веб-версии BioUML, то для удаления нужно:

  1. Нажать на обозначение хемотаксиса ПКМ.

  2. В раскрывающемся списке нажать ЛКМ на Remove icon_remove_element.