Создание субстрата

Чтобы создать субстрат, нужно на верхней панели нажать ЛКМ на icon_substrate, а затем нажать ЛКМ в любое место под панелью инструментов.

Substrate_creation


После этого в появившемся окне необходимо задать параметры создаваемого субстрата:

Substrate_parameters


  • Name: название субстрата,

  • Initial condition: исходное количество субстрата в каждой ячейке среды.

  • Decay rate: скорость разложения субстрата в среде.

  • Diffusion coefficient: скорость диффузии субстрата в среде.

  • X min: граничное условие для концентрации субстрата на границе среды X = Xmin.

  • X max: граничное условие для концентрации субстрата на границе среды X = Xmax.

  • Y min: граничное условие для концентрации субстрата на границе среды Y = Ymin.

  • Y max: граничное условие для концентрации субстрата на границе среды Y = Ymax.

  • Z min: граничное условие для концентрации субстрата на границе среды Z = Zmin.

  • Z max: граничное условие для концентрации субстрата на границе среды Z = Zmax.

Примечание

  • Граничное значение означает что на соответствующей границе среды поддерживается заданное значение концентрации постоянно.

  • Для отключения соответствующего граничного условия нужно задать значение -1.

После того, как заданы все параметры, нажмите Ok.

На экране у вас появится обозначение созданного вами субстрата.

Substrates


Таким образом можно создать любое количество субстратов в модели.

Чтобы переместить субстрат на диаграмме, необходимо зажать ЛКМ субстрат, переместить курсор на новое место и отпустить ЛКМ.

Чтобы удалить субстрат из модели, необходимо нажать на него ЛКМ и нажать клавишу Delete.

Если вы работаете в веб-версии BioUML, то для удаления нужно:

  1. Нажать на обозначение субстрата ПКМ.

  2. В раскрывающемся списке нажать ЛКМ на Remove icon_remove_element.

Чтобы редактировать уже созданный тип субстрата, нужно:

  1. Нажать ПКМ на обозначение соответствующего субстрата на диаграмме.

  2. В раскрывающемся списке нажать ЛКМ на кнопку Edit.

  3. Изменить нужные свойства.

  4. Нажать Ok.