Сохранение данных о клетках в текстовых файлах (Save cells data)

Если опция icon_option Save cells data включена, то после завершения симуляции в директории с результатами у вас будет находиться папка с названием Cells.

В этой папке находятся текстовые файлы с названием Cells_[модельное время]. Значение модельного времени, указанное в названии, говорит о том, через сколько временных единиц после начала симуляции был сгенерирован данный текстовый файл.

Количество текстовых файлов будет зависеть от значений параметров Max Time и Image interval (см. пример ниже).

Пример
Image interval = 20 (текстовые файлы сохраняются через каждые 20 модельных временных единиц).
Max Time = 100 (симуляция длится 100 модельных временных единиц).

Текстовые файлы в папке Cells:
- Cells_0000,
- Cells_0020,
- Cells_0040,
- Cells_0060,
- Cells_0080,
- Cells_0100.

В этих текстовых файлах для каждой клетки в модели представлены следующие данные:

  • X: координата клетки по оси X.

  • Y: координата клетки по оси Y.

  • Z: координата клетки по оси Z.

  • Radius: радиус клетки.

  • r: радиус ядра клетки.

  • Color1: цвет, с помощью которого отрисовывается внутреннее содержимое клетки.

  • Color2: цвет, с помощью которого отрисовывается контур клетки.

  • Color3: цвет, с помощью которого отрисовывается внутреннее содержимое ядра клетки.

  • Color4: цвет, с помощью которого отрисовывается контур ядра клетки.

Примечание

Все цвета представлены в формате RGB.

Примечание

Если в текстовом файле приведено значение только Color1, то считается, что:

  • ядро у клетки не отрисовывается,

  • контур клетки отрисовывается черным цветом [0,0,0],

  • все внутреннее содержимое клетки отрисовывается цветом Color1.

Если в текстовом файле приведены значения только Color1 и Color2, то считается, что:

  • ядро у клетки не отрисовывается,

  • контур клетки отрисовывается цветом Color2,

  • все внутреннее содержимое клетки отрисовывается цветом Color1.

Пример такого текстового файла представлен ниже:

Пример текстового файла
X       Y        Z     Radius r     Color1        Color2        Color3        Color4
410.4   -26.7    0.0   8.4    5.0   [128,128,128]
-298.1  95.8     0.0   8.4    5.0   [128,128,128]
280.3   -119.7   0.0   8.4    5.0   [128,128,128]
179.5   248.1    0.0   8.4    5.0   [128,128,128]
500.1   -160.7   0.0   8.4    5.0   [128,128,128]
320.6   256.4    0.0   8.4    5.0   [128,128,128]
9.2     481.9    0.0   8.4    5.0   [128,128,128]
426.3   -212.8   0.0   8.4    5.0   [128,128,128]
41.0    65.2     0.0   8.4    5.0   [128,128,128]
-104.0  82.0     0.0   8.4    5.0   [128,128,128]