Тип смерти (Death)
После нажатия на вкладку Death на панели свойств справа у вас появится меню, в котором можно изменять параметры смерти клетки.
По умолчанию у клетки есть два вида смерти: Apoptosis (апоптоз) и Necrosis (некроз). При нажатии ЛКМ на панель Death models сверху появится иконка 
, нажав на которую, можно будет добавить еще один возможный тип смерти клетки.
Выбрав конкретный тип смерти клетки, можно использовать этот функционал.
Раскрыв панель определенного типа клеточной смерти, можно детально настроить его параметры.
Rate: начальная вероятность наступления клеточной смерти,
Cycle: цикл клеточной смерти (подробно рассмотрен далее),
Unlysed fluid change rate: скорость изменения объема жидкости клетки во время апоптоза или некроза,
Lysed fluid change rate: скорость изменения объема жидкости клетки во время некроза (при апоптозе этот параметр равен 0),
Cytoplasmic biomass change rate: скорость изменения объема цитоплазмы,
Nuclear biomass change rate: скорость изменения объема ядра,
Calcification rate: скорость кальцификации,
Relative rupture volume: относительный объем клетки, при котором происходит разрыв мембраны,
Time Units: единицы измерения времени.
Изменить значение каждого из параметров можно, нажав ЛКМ на значение справа от соответствующего параметра и введя собственное значение.
Далее разберем как настроить цикл клеточной смерти.
Цикл клеточной смерти (Cycle)
Чтобы настроить цикл клеточной смерти, нужно раскрыть вкладку Cycle определенного типа клеточной смерти.
После этого у вас появятся новые поля, которые можно редактировать.
Name: название цикла клеточной смерти,
Custom cycle: путь к модели, описывающей пользовательский цикл клеточной смерти (необходимо указать, если в предыдущем пункте выбрано «Custom...»),
Phases: фазы цикла клеточной смерти,
Transitions: переходы между фазами цикла клеточной смерти.
Настройка фаз и переходов происходит с помощью этого функционал.
При открытии любой из вкладок поля Phases появляется значок 
Remove on exit. Отметьте ☑, если хотите, чтобы клетка исчезала из модели при выходе из данной фазы.
При открытии любой из вкладок поля Transitions появятся два значка:
- Rate: скорость перехода между соответствующими фазами цикла клеточной смерти (можно изменять, нажав ЛКМ на число и вписав собственное значение),
- Fixed: отметьте ☑, если хотите, чтобы время перехода между соответствующими фазами цикла клеточной смерти было зафиксировано.
Примечание
При указании свойства Fixed переход между фазами цикла клеточной смерти происходит ровно через \(1/Rate\) единиц времени поcле начала фазы.
Если Fixed не указано, то переход происходит в среднем через \(1/Rate\) единиц времени почле начала фазы. Моделируется это следующим образом: во время каждого шага агента (клетки) переход может произойти с вероятностью \(Rate*Phenotype \, dt\), где Phenotype dt- шаг модельного времени, с которым происходит обновление внутреннего состояния клеток (задается при настройках симуляции модели).